報告様式は、「インフルエンザ様疾患の報告様式」と「感染性胃腸炎の報告様式」があります。
「インフルエンザ様疾患の報告様式」を使用する場合の疾患（症状）は、主に以下のものが挙げられます。
・インフルエンザ
・新型コロナウイルス感染症
・手足口病
・ヘルパンギーナ
・水痘（みずぼうそう）
・RSウイルス感染症
・伝染性紅斑（りんご病）
・咽頭結膜熱（プール熱）
・流行性耳下腺炎（おたふくかぜ）
「感染性胃腸炎の報告様式」を使用する場合の疾患（症状）は、主に以下のものが挙げられます。
・下痢、腹痛
・嘔気、嘔吐
・ノロウイルス感染症
・ロタウイルス感染症
インフルエンザ様疾患 ※新型コロナウイルス感染症も含まれます。
・【施設・医療機関用】 感染症報告書（様式１）
様式１ーイ 
様式１ーイ
・【施設・医療機関用】 健康調査表（様式２）
様式２ーイ 様式２ーイ
・【保育園・幼稚園用】 感染症報告書（様式１）
様式１ーイホ 様式１ーイホ
・【保育園・幼稚園用】 健康調査表（様式２）
様式２ーイホ 様式２ーイホ
感染性胃腸炎
・【施設・医療機関用】 感染症報告書（様式１）
様式１−ノ 様式１ーノ
・【施設・医療機関用】 健康調査表（様式２）
様式２ーノ 様式２−ノ
・【保育園・幼稚園用】 感染症報告書（様式１）
様式１ーノホ 様式１ーノホ
・【保育園・幼稚園用】 健康調査表（様式２）
様式２−ノホ 様式２ーノホ